Иногда хочется узнать, какие файлы есть в одной директории, но которых нет в другой (или наоборот). Самой простой способ - команда diff
diff -q dir1 dir2
Если хочется программной обработки, то можно вот таким способом (показывает какие из файлов в dir1 отсутствуют в dir2):
for i in dir1/*; do
if [ -f $i -and \( ! -e dir2/`basename $i` \) ]; then
# do something
echo $i
fi;
done